NCHU Course Outline |
Course Name | (中) R語言於生物資訊分析應用(6933) | ||||
(Eng.) R in Action for Bioinformatic Analysis | |||||
Offering Dept | Master Program in Plant Health Care | ||||
Course Type | Elective | Credits | 2 | Teacher | Tao-Ho Chang |
Department | Doctoral Program in Plant Health CarePh.D | Language | 中/英文 | Semester | 2025-SPRING |
Course Description | This course is designed to teach students how to use the R programming language for data analysis in bioinformatics. Through practical case studies, students will master the application of R in various aspects of bioinformatics, including data manipulation, statistical analysis, machine learning techniques, and data visualization. The main content for the course will be as followed: R Language Fundamentals Bioinformatics Data Processing Biological Statistical Analysis Data Visulisation |
||||
Prerequisites | self-directed learning in the course | N |
Relevance of Course Objectives and Core Learning Outcomes(%) | Teaching and Assessment Methods for Course Objectives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Course Objectives | Competency Indicators | Ratio(%) | Teaching Methods | Assessment Methods | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Develop basic skills in R program Establishment of Bioinformatic analysis Expertise the data visulisation |
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Course Content and Homework/Schedule/Tests Schedule | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Evaluation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Group discussion participation (30%) Presentation (20%) Assignment of practices (50%) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Textbook & other References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kabacoff, R.I. (2015). R in action: data analysis and graphics 2nd Ed. (USA: Manning publication). Bioconductor: https://www.bioconductor.org/ |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Teaching Aids & Teacher's Website | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
R program and R Studio Bioconductor |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Office Hours | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TBD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sustainable Development Goals, SDGs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Please respect the intellectual property rights and use the materials legally.Please respect gender equality. | |
Update Date, year/month/day:2025/02/11 15:57:26 | Printed Date, year/month/day:2025 / 2 / 16 |
The second-hand book website:http://www.myub.com.tw/ |