國立中興大學教學大綱
課程名稱 (中) 生物資訊與作物育種(5116)
(Eng.) Bioinformatics in Crop Breeding
開課單位 農藝系
課程類別 選修 學分 2 授課教師 鄭舒允
選課單位 農藝系 / 碩士班 授課使用語言 英文 英文/EMI Y 開課學期 1122
課程簡述 Introduce the evolution of bioinformation and its tools, besides, encourage students to get familiar with the successful applications.
先修課程名稱
課程含自主學習 N
課程與核心能力關聯配比(%) 課程目標之教學方法與評量方法
課程目標 核心能力 配比(%) 教學方法 評量方法
Understand the differences among different bioinformation tools and how to select the right one to fit your task
專題探討/製作
習作
討論
出席狀況
口頭報告
作業
授課內容(單元名稱與內容、習作/每週授課、考試進度-共18週)
週次 授課內容
第1週 Introduction
第2週 Introduce different online databases
第3週 The history of sequencing
第4週 R program introduction
第5週 Group comparisons and data cleanning
第6週 Data visualisations in R
第7週 Correlations
第8週 Expression analysis
第9週 Mid-term
第10週 Comparing the means of more than two groups
第11週 Plant Image Analysis
第12週 Variations in the arguments of analyze objects
第13週 RGB values for each object
第14週 Group report I
第15週 Group report II
第16週 How to analysis RNA-seq data : online learning
第17週 How to do the SNP calling: online learning
第18週 Final exam
學習評量方式
1. Midterm report (40%)
2. Final oral present (40%)
3. Homework (20%)
教科書&參考書目(書名、作者、書局、代理商、說明)
1. Plant Bioinformatics methods and protocols (Edwards, David. 2016).
2. R Bioinformatics Cookbook (Dan MacLean, 2019)
課程教材(教師個人網址請列在本校內之網址)

課程輔導時間

聯合國全球永續發展目標
 提供體驗課程:N
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更新日期 西元年/月/日:無 列印日期 西元年/月/日:2024 / 5 / 03
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