國立中興大學教學大綱
課程名稱 (中) 生物資料處理與分析(6244)
(Eng.) Biological Data Processing and Analysis
開課單位 動科系
課程類別 選修 學分 3 授課教師 辛坤鎰
選課單位 動科系 / 碩士班 授課使用語言 英文 英文/EMI Y 開課學期 1122
課程簡述 This course aims to teach students the state-of-the-art methodologies and algorithms in biological data processing and analysis. In addition, the course includes two hands-on case studies allowing students to practice skills taught in the lectures. Students will be capable of processing and analyzing complex biological data, leading thoughtful perspective in elaborating biological phenomena observed.
先修課程名稱
課程含自主學習 Y
課程與核心能力關聯配比(%) 課程目標之教學方法與評量方法
課程目標 核心能力 配比(%) 教學方法 評量方法
to teach students the data processing and data mining skill.
講授
討論
習作
專題探討/製作
其他
作品
出席狀況
授課內容(單元名稱與內容、習作/每週授課、考試進度-共18週)
週次 授課內容
第1週 Introduction to biological data.
第2週 Data structure and pattern.
第3週 Data sampling, mining and modeling.
第4週 Data validation and virtualization.
第5週 Data pattern recognition.
第6週 Large-scale data (big-data) and image data processing.
第7週 Introduction to R.
第8週 R programing for large-scale data analysis.
第9週 R programing for data visualization.
第10週 Introduction to data dimension reduction.
第11週 Introduction to data similarity.
第12週 Introduction to data clustering.
第13週 Introduction to Artificial Intelligence (AI) and machine learning
第14週 Supervised machine learning.
第15週 Unsupervised machine learning.
第16週 Application of Neuro Network and Deep Learning in biological modeling. Discussion and Review.
第17週 Self-study - I: Practice on case study of causality analysis between factors.
第18週 Self-study - II: Practice on case study of explanatory machine learning.
學習評量方式
participation rate, homeworks
教科書&參考書目(書名、作者、書局、代理商、說明)
1. Witten, I. H., E. Frank, M. A. Hall, and C. J. Pal. 2016. Data Mining: Practical machine learning tools and techniques. Morgan Kaufmann.
2. Heath, L. S., and N. Ramakrishnan. 2010. Problem Solving Handbook in Computational Biology and Bioinformatics. Springer Science & Business Media.
3. Robert Gentleman. R Programming for Bioinformatics. 2008. CRC Computer Science & Data Analysis
課程教材(教師個人網址請列在本校內之網址)

課程輔導時間
Working hour or by appointment.
聯合國全球永續發展目標
提供體驗課程:N
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更新日期 西元年/月/日:2024/01/13 23:45:11 列印日期 西元年/月/日:2024 / 5 / 09
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