國立中興大學教學大綱
課程名稱 (中) 圖像解析分子結構實務(5193)
(Eng.) Practical Approach of Biomolecular Graphics and Structural Analysis
開課單位 生化所
課程類別 選修 學分 3 授課教師 羅文廷
選課單位 生科系 / 學士班 授課使用語言 中文 英文/EMI 開課學期 1141
課程簡述 熟悉運用蛋白資料庫包含PDB, EM, AI所建置的蛋白質資料庫,分析並學習3D分子結構視覺軟體,藉由結構瞭解生化分子的生化功能。熟悉使用結構視覺軟體, 利用軟體分析的生化分子結構以及展示運用。讓學生培養出分析生化分子結構的能力,能夠根據蛋白質結構所提供資訊息,推測出蛋白質的功能,並設計實驗去印證自己的假設。上課後學生會使用分子結構預測軟體,結構軟體(pymol),瞭解分子結構座標模式,瞭解分子的生化功能與結構關連性的範例,能由分子結構參考文獻,設計及繪製分子結構圖,演示分子的生化功能。
Proficient in using major protein databases to retrieve and understand protein structures. The lectures will provide instruction on utilizing 3D molecular structure visualization software to analyze and learn the biochemical functions of biomolecules through their structures. This involves the combination of structural analysis software to analyze and demonstrate structure-function relationships.
During the lecture, students will perform hands-on activities with molecular structure prediction software, structural software (e.g., PyMOL), and other analysis tools to understand molecular structure coordinate models and the relationship between biochemical functions and structures. Based on selected literature, students will learn how to present structural biology works.
先修課程名稱
課程含自主學習 Y
課程與核心能力關聯配比(%) 課程目標之教學方法與評量方法
課程目標 核心能力 配比(%) 教學方法 評量方法
運用AI模型建置大數據資料庫,分析並學習3D分子結構視覺軟體,瞭解生化分子的結構及功能。
6.生物科技的研究內容
100
專題探討/製作
習作
討論
講授
出席狀況
書面報告
口頭報告
作業
授課內容(單元名稱與內容、習作/每週授課、考試進度-共16週加自主學習)
週次 授課內容
第1週 課程介紹-3D分子結構
第2週 Protein data bank 介紹
第3週 PDB分子座標格式介紹
第4週 蛋白質結構預測技術演變
第5週 結構預測的操作與應用
第6週 結構分析與蛋白質功能分析
第7週 結構分析與藥物發展
第8週 期中測驗及練習:生化分子結構觀念測驗以及練習預測蛋白質結構並進行結構以及功能分析(課堂操作)
第9週 PyMol軟體基本操作
第10週 PyMol軟體基本操作
第11週 PyMol軟體進階操作
第12週 PyMol動畫製作
第13週 PyMol動畫製作
第14週 分析Protein ligand interactions and protein ligand pocket
第15週 蛋白質結構實作分析
第16週 利用PyMol製作書報討論 自主學習-參與學期中生科院任一場次專題演講並繳交心得報告 自主學習-參與學期中生科院任一場次專題演講並繳交心得報告
自主學習
內容

學習評量方式
蛋白結構預測以及功能分析操作實作; 利用分子結構動畫來製作書報討論
教科書&參考書目(書名、作者、書局、代理商、說明)
教師PPT
課程教材(教師個人網址請列在本校內之網址)
教師PPT
課程輔導時間
課程結束後
聯合國全球永續發展目標(連結網址)
04.教育品質提供體驗課程:N
請尊重智慧財產權及性別平等意識,不得非法影印他人著作。
更新日期 西元年/月/日:無 列印日期 西元年/月/日:2025 / 6 / 15
MyTB教科書訂購平台:http://www.mytb.com.tw/