國立中興大學教學大綱

課程名稱	(中) 高等昆蟲分類學(8000)
	(Eng.) Advanced Insect Taxonomy
開課單位	昆蟲系
課程類別	選修	學分	2	授課教師	蕭昀
選課單位	昆蟲博 / 博士班	授課使用語言	英文	開課學期	1151
課程簡述	生物系統分類學是一門歷久彌新的重要學門，其起源自基於形態特徵觀察的分類鑑定，以及隨之而生的物種命名發表。然而，當代的系統分類學研究不僅止於此。隨著時代演進，除了高解析度觀察設備與顯微攝影技術的突飛猛進，更因為標準化分子親緣分析、物種界定、地理分布與環境因子圖層分析，以及親緣比較方法（PCMs）的成熟，使其在研究深度與廣度上有了飛躍式的進展。本課程將橫跨親緣分析、物種界定、空間分析、幾何形態學、量化形態分析以及親緣比較分析法，介紹其實用分析方法並帶領學生動手實作。修課學生應具備基本的親緣分析、統計學及 R 語言操作能力。 Biological systematics is an enduring and vital discipline, originating from morphology-based species identification and subsequent taxonomic descriptions. However, contemporary systematic research extends far beyond these traditional foundations. Driven by rapid advancements in high-resolution imaging technologies, alongside the integration of standardized molecular phylogenetics, species delimitation, spatial analysis, and phylogenetic comparative methods (PCMs), the field has experienced a quantum leap in both its scope and depth. This course spans phylogenetic reconstruction, species delimitation, spatial analysis, geometric morphometrics, quantitative morphological analysis, and evolutionary comparative methods. Blending theoretical foundations with hands-on practical sessions, students are expected to possess baseline knowledge in phylogenetics, statistics, and R programming.
先修課程名稱

課程與核心能力關聯配比(%)

課程目標之教學方法與評量方法

課程目標

核心能力

配比(%)

教學方法

評量方法

1. 了解符合當代前沿標準的系統分類學研究分析方法。
To understand and master cutting-edge analytical methods that meet the rigorous standards of contemporary systematic research.
2. 充實並拓展個人研究專題的廣度與深度。
To enrich and expand both the breadth and depth of students' individual research projects.

1.具備獨立思考及發掘問題之能力

2.具備執行實驗、數據分析、歸納詮釋之能力

3.具備研究成果發表能力

4.具備正確科學倫理與態度

專題探討/製作

習作

講授

出席狀況

口頭報告

授課內容(單元名稱與內容、習作/每週授課、考試進度-共16週加自主學習)

週次	授課內容
第1週	9/10:課程概述 (Introduction to the Course) & 何謂現代標準的系統分類學研究? (What Constitutes a Modern Standard Systematic Study?)
第2週	9/17:分子親緣分析：序列比對與資料分區、分子演化模型選擇、拔靴法、與鄰接聚類法 (Molecular Phylogenetic Analysis: Alignment and Partitions, Evolutionary Model Selection, Bootstrapping and Neighbor-Joining Method)
第3週	9/24:分子親緣分析：最大似然法與貝氏親緣分析 (Molecular Phylogenetic Analysis: Maximum Likelihood and Bayesian Methods)
第4週	10/1:當代昆蟲系統分類學專題演講 (Special Topic Lecture on Systematic Entomological Research)
第5週	10/8:分子物種界定 (Molecular Species Delimitation)
第6週	10/15:物種分布地圖和空間分析 (Species Distribution Map and Spatial Analysis)
第7週	10/22:引導式自主期中專題研究與方法學諮詢 (Guided Independent Midterm Project Research and Methodology Consultation)
第8週	10/29:期中口頭報告 (Mid-Term Oral Presentation)
第9週	11/5:利用離散特徵進行親緣關係重建 (Morphology-based Phylogenetic Analysis)
第10週	11/12:當代昆蟲系統分類學專題演講 (Special Topic Lecture on Systematic Entomological Research)
第11週	11/19:幾何形態分析和形態多樣性分析 (Morphometrics & Morphological Diversity Analysis)
第12週	11/26:分化時間估算 (Divergence Time Estimation)
第13週	12/3:生物地理歷史重建 (Ancestral Distribution Reconstruction)
第14週	12/10:祖徵估算 (Ancestral Character State Reconstruction)
第15週	12/17:引導式自主期末專題研究與方法學諮詢 (Guided Independent Final Project Research and Methodology Consultation)
第16週	12/24:期末口頭報告 (Final Oral Presentation)
自主學習內容	03.製作專題報告將要求學生利用課堂學習知識，自行選擇主題、分析資料以進行兩次口頭報告，自主學習內容達2學分4小時之要求。 To fulfill the 2-credit, 4-hour independent learning requirement, students will independently select research topics, analyze data, and deliver two oral presentations by applying the knowledge learned in class.

學習評量方式

期中口頭報告 (40%); 期末口頭報告 (40%); 出席率 (20%)
Mid-Term Oral Presentation (40%); Final Oral Presentation (40%); Presence (20%)
##出席規定 Presence
曠課
1) 按學校規定：學生缺課時數達該全學期上課時數三分之一者，不得參加該科目之學期考試，該科目學期成績以零分計
2) 若未超過三分之一者，每次缺課扣學期總分三分，扣至分數佔比20％為止
Unexcused Absences:
1) University Regulations: In accordance with school policy, any student whose total hours of absence reach one-third of the total scheduled class hours for the semester shall be disqualified from taking the final examination. In such cases, the final grade for the course will be recorded as zero.
2) Grading Deductions: For students whose absences do not exceed the one-third threshold, a 3-point deduction will be applied to the final grade for each occurrence, up to a maximum total deduction of 20% of the final grade.

教科書＆參考書目(書名、作者、書局、代理商、說明)

1. Brower, A.V.Z. and Schuh, R.T. 2021. Biological Systematics: Principles and Applications (3rd edn). Ithaca, NY; online edn, Cornell Scholarship Online. https://doi.org/10.7591/cornell/9781501752773.001.0001
2. Bromham, L. 2016. An Introduction to Molecular Evolution and Phylogenetics (2nd edn). Oxford University Press.
3. Compiled from selected academic journal papers參考學術期刊論文自行彙編

課程教材（教師個人網址請列在本校內之網址）

I-Learning

課程輔導時間

by email (教師電子郵件約時間)

請尊重智慧財產權及性別平等意識，不得非法影印他人著作及受保護的電子檔案。
更新日期西元年/月/日：2026/09/12 16:52:02	列印日期西元年/月/日：2026 / 9 / 18
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