國立中興大學教學大綱

課程名稱	(中) R語言於生物資訊分析應用(6933)
	(Eng.) R in Action for Bioinformatic Analysis
開課單位	植保碩士學程
課程類別	選修			學分	2	授課教師	張道禾
選課單位	植保碩士學程 / 碩士班			授課使用語言	中/英文	開課學期	1142
課程簡述	This course is designed to teach students how to use the R programming language for data analysis in bioinformatics. Through practical case studies, students will master the application of R in various aspects of bioinformatics, including data manipulation, statistical analysis, machine learning techniques, and data visualization. The main content for the course will be as followed: R Language Fundamentals Bioinformatics Data Processing Biological Statistical Analysis Data Visulisation
先修課程名稱

課程與核心能力關聯配比(%)			課程目標之教學方法與評量方法
課程目標	核心能力	配比(%)	教學方法	評量方法
Develop basic skills in R program Establishment of Bioinformatic analysis Expertise the data visulisation			討論 講授	出席狀況 作業 其他
授課內容(單元名稱與內容、習作/每週授課、考試進度-共16週加自主學習)
週次 授課內容 第1週 Course introduction and semester quest of the course 第2週 Basic R program function 第3週 Experiment designing in R program 第4週 Tidy your data: Tidyverse 第5週 Statistical analysis in R 第6週 Graphic language in R: an introduction 第7週 Basic data visualisation with ggplot2 in R 第8週 Self-learning week 第9週 Making your own apps with Shiny 第10週 Making your own apps with Shiny 第11週 Bioconductor: Whole packages for bioinformatics 第12週 Bioconductor: Whole packages for bioinformatics 第13週 Complexheatmap for holoinformation 第14週 Complexheatmap for holoinformation 第15週 Oral presentation: What is your app? 第16週 Oral presentation: What is your app? 自主學習 內容    03.製作專題報告
學習評量方式
Group discussion participation (30%) Presentation (20%) Assignment of practices (50%)
教科書＆參考書目(書名、作者、書局、代理商、說明)
Kabacoff, R.I. (2015). R in action: data analysis and graphics 2nd Ed. (USA: Manning publication). Bioconductor: https://www.bioconductor.org/
課程教材（教師個人網址請列在本校內之網址）
R program and R Studio Bioconductor
課程輔導時間
TBD
聯合國全球永續發展目標(連結網址)
08.就業與經濟成長   09.工業、創新基礎建設 提供體驗課程：N

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更新日期 西元年/月/日：2026/02/11 19:46:56	列印日期 西元年/月/日：2026 / 3 / 15
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