| 國立中興大學教學大綱 |
| 課程名稱 | (中) 植物基因體學(6365) | ||||||||
| (Eng.) Plant Genomics | |||||||||
| 開課單位 | 生技所 | ||||||||
| 課程類別 | 選修 | 學分 | 2 | 授課教師 | 呂維茗 等 | ||||
| 選課單位 | 生技所 / 碩士班 | 授課使用語言 | 中文 | 開課學期 | 1142 | ||||
| 課程簡述 | 隨著基因組解序技術的飛速進步與成本下降，基因體學已從單一基因的研究演變為現代生物學的核心工具，尤其在植物科學領域更顯關鍵 。相較於人類與動物模式生物擁有完善的基因體資源，植物物種繁多且基因體複雜，研究往往需從零開始，對特定物種進行序列解碼、組裝與註解，才能建立基礎研究工具 。本課程旨在帶領碩士班學生深入掌握從 DNA 定序、大數據序列分析、基因表現偵測，到差異表現基因群解析的完整流程，並探索後基因體時代（Post-genomic era）的研究趨勢 。 課程內容涵蓋四大核心領域： (1) 基因體結構與定序策略：除了傳統桑格定序與次世代定序（NGS），課程將深入介紹第三代定序技術（如 PacBio SMRT 與 Nanopore）及光學圖譜技術，並探討 Telomere-to-Telomere (T2T) 的完整組裝策略 。學生將學習構建染色體圖譜、物理圖譜與遺傳圖譜，並應用多種 DNA 分子標誌（如 SNP, SSR）進行關聯性分析（GWAS）與分子輔助育種（MAS） 。 (2) 功能基因體學（Functional Genomics）：課程涵蓋 mRNA 表現圖譜分析技術，包括微陣列（Microarray）與 RNA-Seq 的數據探勘（如 PCA 分析、GO enrichment） 。此外，將介紹高靈敏度的核酸定量技術，如即時定量 PCR (qPCR) 與數位 PCR (ddPCR) 的原理與應用 。 (3) 基因功能解析與編輯技術：探討反向遺傳學策略，包括 RNA 干擾（RNAi）、VIGS 等基因靜默技術 。重點單元將聚焦於 CRISPR/Cas9 基因編輯系統，從細菌免疫機制的原理、gRNA 設計、脫靶效應分析，到精準育種的實際應用案例，進行全方位的解析 。 (4) 實驗設計與實作思維：課程設有「學生主導之實驗設計工作坊」，引導學生針對特定植物基因，規劃包含基因靜默、過量表現或基因編輯的完整實驗藍圖，培養獨立研究與解決問題的能力 。 透過本課程，學生不僅能熟悉最前沿的基因體學技術與生物資訊資料庫資源 ，更將學會如何將這些工具轉化為解決植物科學問題的策略，為未來的學術研究或生技產業應用奠定堅實基礎。 |
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| 先修課程名稱 | |||||||||
| 課程與核心能力關聯配比(%) | 課程目標之教學方法與評量方法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 課程目標 | 核心能力 | 配比(%) | 教學方法 | 評量方法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1. 期望學生獲知現今基因體學的發展，技術與應用。 |
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| 授課內容(單元名稱與內容、習作/每週授課、考試進度-共16週加自主學習) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 學習評量方式 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 於課程結束後進行口頭報告(楊長賢老師)； 於課程中進行隨堂考 (呂維茗老師); 書面與口頭報告各占比 50%(黃纓雯老師) |
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| 教科書＆參考書目(書名、作者、書局、代理商、說明) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 參考資料為期刊文章或是網路資料庫，無教科書。 |
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| 課程教材（教師個人網址請列在本校內之網址） | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 將提供電子檔給修課同學 |
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| 課程輔導時間 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 每週二下午4~6 PM |
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| 聯合國全球永續發展目標(連結網址) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 更新日期 西元年/月/日：2026/01/09 23:03:20 | 列印日期 西元年/月/日：2026 / 4 / 06 |
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