國立中興大學教學大綱
課程名稱 (中) 次世代定序資料分析與實作(7018)
(Eng.) Data Analysis and Implementation of Next Generation Sequencing
開課單位 基資所
課程類別 選修 學分 2 授課教師 蕭自宏
選課單位 基資所 / 碩士班 授課使用語言 中文 英文/EMI N 開課學期 1072
課程簡述 課程中會邀請具備基因體學以及生物資訊專長的教授講師相來校授課,讓學生學習相關專業知識。除此之外,課程也將會安排實際上機操作,藉由實際分析次世代定序資料,進而培養學生之實務經驗。課程成績將由學生的上機操作的分析結果報告來評分。
先修課程名稱
課程含自主學習 N
課程與核心能力關聯配比(%) 課程目標之教學方法與評量方法
課程目標 核心能力 配比(%) 教學方法 評量方法
本課程的目標在於學習次世代定序,除教授分析原理,並培養同學實際分析次世代定序資料的能力。
習作
講授
出席狀況
測驗
授課內容(單元名稱與內容、習作/每週授課、考試進度-共18週)
週次 教學概要

1. 課程介紹
2. 基因體學簡介
3. 次世代定序原理簡介
4. 生物資訊簡介
5. NGS data QC實務教學
6. DNA-seq 實務教學
7. DNA-seq 實務教學
8. RNA-seq實務教學
9. RNA-seq實務教學
10. De novo assembly簡介
11. 科技新知 10X genomeics 簡介
12. 科技新知 第三代長序列定序簡介
13. RNA De novo assembly: Trinity 實務教學
14. BLAST簡介與實務操作
15. Metagenomics 分析實務教學
16. Metagenomics 分析實務教學
17. GWAS 簡介18. 期末考
學習評量方式
課堂參與(40%)
考試(60%)
教科書&參考書目(書名、作者、書局、代理商、說明)

課程教材(教師個人網址請列在本校內之網址)

課程輔導時間

聯合國全球永續發展目標
 提供體驗課程:N
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更新日期 西元年/月/日:無 列印日期 西元年/月/日:2024 / 9 / 18
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