國立中興大學教學大綱
課程名稱 (中) 分子演化學(7117)
(Eng.) Molecular Evolution
開課單位 昆蟲系
課程類別 選修 學分 3 授課教師 蕭昀
選課單位 昆蟲系 / 碩士班 授課使用語言 英文 開課學期 1142
課程簡述 本課程將介紹微觀分子尺度的演化生物學,課程涵蓋分子演化研究的基礎概念、分子序列資料處理、分子演化的模型、分子親緣譜系重建、分子定年、常用的分子演化軟體、及以分子親緣關係為基礎的演化分析方法。學生須自備電腦以供操作分析使用。建議修習同學有分子生物學或遺傳學基礎。
This course introduces evolutionary biology at the molecular level. It covers fundamental concepts in molecular evolution, sequence data analysis, models of molecular evolution, molecular phylogenetic reconstruction, molecular dating, commonly used software for molecular phylogenetics, and research methods based on molecular phylogenetic frameworks. Students are required to bring their own laptops for hands-on data analysis during the course. Prior coursework or background in molecular biology or genetics is recommended.
先修課程名稱
課程與核心能力關聯配比(%) 課程目標之教學方法與評量方法
課程目標 核心能力 配比(%) 教學方法 評量方法
理解分子演化基本知識和應用方法
1.具備獨立思考及發掘問題之能力
4.具備正確科學倫理與態度
50
50
專題探討/製作
習作
講授
書面報告
出席狀況
口頭報告
測驗
授課內容(單元名稱與內容、習作/每週授課、考試進度-共16週加自主學習)
週次 授課內容
第1週 2/26:
課程概述
分子演化簡史 (Introduction to the Course and History of Molecular Evolution)
基因與突變 (Gene and Mutation)、族群遺傳學 (Population Genetics)
第2週 3/5:族群遺傳學 (Population Genetics) 、中性演化 (Neutral Evolution)
第3週 3/12:自然選汰 (Natural Selection)
第4週 3/19:演化模型 (Evolutionary Models)
第5週 3/26:親緣關係樹 (Phylogenetic Tree)
第6週 4/2:分子親緣關係重建中常使用的數據資料類型與技術及常用資料庫
(Commonly Used Dataset Types, Database and Relevant Technologies in Molecular Phylogenetic Reconstruction)
第7週 4/9:分子親緣數據資料處理:序列比對與資料分區
(Data Processing in Molecular Phylogenetics: Alignment and Partitions)
第8週 4/16:期中考 (Mid-term)
第9週 4/23:分子親緣重建的方法和類別:基於遺傳距離的方法和最大簡約法
(Methods in Molecular Phylogenetics: Distance-Based Methods and Maximum Parsimony)
第10週 4/30:分子親緣重建的方法和類別:最大似然法與拔靴法和操作
(Methods in Molecular Phylogenetics: Maximum Likelihood and Bootstrapping)
第11週 5/7:分子親緣重建的方法和類別:貝氏親緣分析
(Methods in Molecular Phylogenetics: Bayesian Phylogenetic Analysis)
第12週 5/14:分子定年分析 (Molecular Dating Analysis)
第13週 5/21:應用分子演化分析於物種鑑定 (Molecular Species Delimitation)
第14週 5/28:祖先特徵重建估算 (Reconstruct Ancestral Character State)
第15週 6/4:根據分子親緣關係樹進行演化速率分析
(Diversification Rate Estimation based on Time-scaled Phylogenetic Trees)
第16週 6/11:期末分組報告 (Final Presentation)
自主學習
內容
   03.製作專題報告
將要求學生利用課堂學習知識,自行分析資料以進行分組口頭報告並撰寫繳交書面報告,自主學習內容達3學分6小時之要求
學習評量方式
期中考 (40%); 期末分組口頭報告 (25%);期末分組書面報告 (25%); 出席率 (10%)
Mid-Term (40%); Final Group Oral Presentation (25%); Final Group Written Presentation (25%); Presence (10%)
##出席規定 Presence
曠課
1) 按學校規定:學生缺課時數達該全學期上課時數三分之一者,不得參加該科目之學期考試,該科目學期成績以零分計
2) 若未超過三分之一者,每次缺課扣學期總分三分,扣至分數佔比10%為止
Unexcused Absences:
1) University Regulations: In accordance with school policy, any student whose total hours of absence reach one-third of the total scheduled class hours for the semester shall be disqualified from taking the final examination. In such cases, the final grade for the course will be recorded as zero.
2) Grading Deductions: For students whose absences do not exceed the one-third threshold, a 3-point deduction will be applied to the final grade for each occurrence, up to a maximum total deduction of 10% of the final grade.
教科書&參考書目(書名、作者、書局、代理商、說明)
Bromham, L. 2016. An Introduction to Molecular Evolution and Phylogenetics (2nd edn). Oxford University Press.
Graur, D. and Li, W.-H. 1999. Fundamentals of Molecular Evolution (2nd edn). Oxford University Press.
課程教材(教師個人網址請列在本校內之網址)
I-Learning
課程輔導時間

聯合國全球永續發展目標(連結網址)
04.教育品質提供體驗課程:N
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更新日期 西元年/月/日:2026/03/05 17:17:01 列印日期 西元年/月/日:2026 / 3 / 23
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